Terça-feira, 8 de julho de 2014. - Uma equipe de pesquisadores do Instituto Vall d'Hebron de Recerca (VHIR) participou de uma investigação internacional que identificou 518 novas microbactérias, completamente desconhecidas até agora, na microbiota humana (flora intestinal).
A pesquisa, na qual os cientistas empregaram uma nova abordagem para a análise bioinformática, também expandiu o catálogo de genes microbianos conhecidos, de 3 para 10 milhões.
Os resultados desta pesquisa, publicada no domingo pela revista Nature Biotechnology, fazem parte do projeto europeu MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), dotado de 11, 4 milhões de euros para investigar como o microbioma humano se relaciona com saúde e doença. . O Instituto Vall de Hebrom de Recerca (VHIR) é um dos 13 participantes deste projeto - e o único centro espanhol - sob a direção do Dr. Francisco Guarner, que explicou que nem todas as amostras estudadas têm esse número de espécies desconhecidas.
As amostras da flora intestinal de alguns indivíduos têm muito poucas dessas espécies e, quando analisadas em detalhes, constatam que são amostras de pacientes com doença de Crohn. "Isso sugere que essas espécies, até agora desconhecidas, são possivelmente as que fazem a diferença entre a microbiota de pessoas saudáveis e a de doentes", anunciou Guarner.
Segundo o pesquisador, esses dados abrem estratégias para tentar recuperar essas espécies com intervenções nutricionais: administração de fibras, prebióticos que auxiliam no crescimento seletivo de algumas espécies ou probióticos.
Essas bactérias desconhecidas são provavelmente as chamadas "boas bactérias" porque não são as típicas que causam uma infecção, nem são conhecidas ou isoladas antes. Segundo Guarner, as bactérias descobertas não podem ser isoladas porque "quase certamente não sobreviveriam fora do cólon para serem transplantadas".
O responsável pelo trabalho e pesquisador do Grupo de Fisiologia e Fisiopatologia Digestiva do VHIR indicou que as novas espécies descobertas "não são cultiváveis, são muito sensíveis ao oxigênio, ou seja, são anaeróbios muito rigorosos e estabelecem uma grande dependência de seu ambiente para poderem sobreviver ". "Pelo mesmo motivo, quando fomos aos bancos de dados, não encontramos nenhum rastro e até agora não sabíamos nada sobre eles", afirmou Guarner.
A descoberta foi possível graças a uma nova abordagem da análise bioinformática que permitiu que essas espécies "aparecessem".
"Atualmente - de acordo com Guarner -, apenas 10% do material genético sequenciado é conhecido com 95% de confiabilidade. Isso deixa uma enorme área cinzenta que está sendo trabalhada atualmente".
O estudo detectou 741 espécies metagenômicas diferentes, nomeadas pela impossibilidade de atribuir um nome a elas. Quando contrastados com os bancos de dados, os pesquisadores viram que 115 dessas espécies já eram conhecidas, enquanto 518 são desconhecidas; os 108 restantes são parcialmente conhecidos.
"Agora sabemos como é o genoma dessas espécies metagenômicas, mas não seus nomes e sobrenomes", explicou Guarner.
Existe um pequeno número cuja espécie não é conhecida, mas o gênero ou a família a que pertencem e aproximadamente 200 espécies metagenômicas das descritas não podem ser classificadas de nenhuma maneira, uma vez que mais de 80% de seus genes são totalmente desconhecidos. dia de hoje.
Segundo os cientistas, os microrganismos que vivem nos seres humanos são cerca de 100 bilhões, 10 vezes mais que o número total de células humanas.
Os resultados iniciais desse mesmo projeto, em 2010, apontaram para 3.300.000 genes diferentes, traduzidos em 20.000 funções diferentes, das quais 5.000 eram totalmente desconhecidas até o momento.
Cada pessoa possui cerca de 600.000 desses genes microbianos e 300.000 são repetidos constantemente entre todos os indivíduos. "Neste novo estudo, o número é multiplicado por três e 9.879.896 genes diferentes são atingidos", afirmou Guarner.
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A pesquisa, na qual os cientistas empregaram uma nova abordagem para a análise bioinformática, também expandiu o catálogo de genes microbianos conhecidos, de 3 para 10 milhões.
Os resultados desta pesquisa, publicada no domingo pela revista Nature Biotechnology, fazem parte do projeto europeu MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), dotado de 11, 4 milhões de euros para investigar como o microbioma humano se relaciona com saúde e doença. . O Instituto Vall de Hebrom de Recerca (VHIR) é um dos 13 participantes deste projeto - e o único centro espanhol - sob a direção do Dr. Francisco Guarner, que explicou que nem todas as amostras estudadas têm esse número de espécies desconhecidas.
As amostras da flora intestinal de alguns indivíduos têm muito poucas dessas espécies e, quando analisadas em detalhes, constatam que são amostras de pacientes com doença de Crohn. "Isso sugere que essas espécies, até agora desconhecidas, são possivelmente as que fazem a diferença entre a microbiota de pessoas saudáveis e a de doentes", anunciou Guarner.
"Boas bactérias"
Segundo o pesquisador, esses dados abrem estratégias para tentar recuperar essas espécies com intervenções nutricionais: administração de fibras, prebióticos que auxiliam no crescimento seletivo de algumas espécies ou probióticos.
Essas bactérias desconhecidas são provavelmente as chamadas "boas bactérias" porque não são as típicas que causam uma infecção, nem são conhecidas ou isoladas antes. Segundo Guarner, as bactérias descobertas não podem ser isoladas porque "quase certamente não sobreviveriam fora do cólon para serem transplantadas".
O responsável pelo trabalho e pesquisador do Grupo de Fisiologia e Fisiopatologia Digestiva do VHIR indicou que as novas espécies descobertas "não são cultiváveis, são muito sensíveis ao oxigênio, ou seja, são anaeróbios muito rigorosos e estabelecem uma grande dependência de seu ambiente para poderem sobreviver ". "Pelo mesmo motivo, quando fomos aos bancos de dados, não encontramos nenhum rastro e até agora não sabíamos nada sobre eles", afirmou Guarner.
Diferentes espécies metagenômicas
A descoberta foi possível graças a uma nova abordagem da análise bioinformática que permitiu que essas espécies "aparecessem".
"Atualmente - de acordo com Guarner -, apenas 10% do material genético sequenciado é conhecido com 95% de confiabilidade. Isso deixa uma enorme área cinzenta que está sendo trabalhada atualmente".
O estudo detectou 741 espécies metagenômicas diferentes, nomeadas pela impossibilidade de atribuir um nome a elas. Quando contrastados com os bancos de dados, os pesquisadores viram que 115 dessas espécies já eram conhecidas, enquanto 518 são desconhecidas; os 108 restantes são parcialmente conhecidos.
"Agora sabemos como é o genoma dessas espécies metagenômicas, mas não seus nomes e sobrenomes", explicou Guarner.
Existe um pequeno número cuja espécie não é conhecida, mas o gênero ou a família a que pertencem e aproximadamente 200 espécies metagenômicas das descritas não podem ser classificadas de nenhuma maneira, uma vez que mais de 80% de seus genes são totalmente desconhecidos. dia de hoje.
Uma pessoa tem 600.000 genes microbianos
Segundo os cientistas, os microrganismos que vivem nos seres humanos são cerca de 100 bilhões, 10 vezes mais que o número total de células humanas.
Os resultados iniciais desse mesmo projeto, em 2010, apontaram para 3.300.000 genes diferentes, traduzidos em 20.000 funções diferentes, das quais 5.000 eram totalmente desconhecidas até o momento.
Cada pessoa possui cerca de 600.000 desses genes microbianos e 300.000 são repetidos constantemente entre todos os indivíduos. "Neste novo estudo, o número é multiplicado por três e 9.879.896 genes diferentes são atingidos", afirmou Guarner.
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