Quarta-feira, 18 de setembro de 2013. - Pesquisadores da Universidade da Califórnia, em San Diego, nos Estados Unidos, propõem uma nova abordagem chamada estratificação baseada em rede (NBS) para identificar subtipos de câncer pela forma como as mutações afetam as redes ou sistemas genéticos compartilhados em vez das mutações únicas de cada paciente, conforme publicado na edição digital avançada deste domingo de 'Nature Methods'.
Os tumores de câncer quase nunca compartilham as mesmas mutações genéticas exatas, fato que confundiu os esforços científicos para classificar melhor os tipos de câncer e desenvolver tratamentos mais específicos e eficazes.
"A subtipagem é o passo mais básico em direção à meta da medicina personalizada", disse o pesquisador principal Trey Ideker, chefe da divisão de Genética da Faculdade de Medicina da Universidade da Califórnia, em San Diego, e professor do Departamento de Medicina. Medicina e Bioengenharia do mesmo centro universitário.
"Com base nos dados do paciente, os pacientes são colocados em subtipos com tratamentos associados. Por exemplo, sabe-se que um subtipo de câncer responde bem ao medicamento A, mas não ao medicamento B. Sem subtipos, cada paciente tem o mesmo aspecto, por definição, e não sabemos como lidar de maneira diferente ", explicou.
Os recentes avanços no conhecimento e na tecnologia tornaram mais fácil (e mais barato) sequenciar genomas individuais, especialmente no tratamento de câncer, que é fundamentalmente uma doença dos genes.
Mas os genes são "tremendamente heterogêneos", disse Ideker. Os genes mutantes, influenciados por outros fatores, causam doenças como o câncer, uma patologia geneticamente única em cada paciente, fato que pode afetar a eficácia e os resultados do tratamento clínico.
"Quando analisamos os dados dos pacientes no nível dos genes, todos parecem diferentes", disse Ideker. "Mas se você olhar para as redes e os sistemas biológicos afetados, eles parecem ser aglomerados. Não há genes mutados no mesmo lugar, mas as mutações aparecem nos mesmos caminhos genéticos", disse esse especialista.
Especificamente, os cientistas observaram mutações somáticas, presentes em tumores, mas não em tecidos saudáveis, em dados de pacientes com câncer de pulmão, uterino e ovário compilados pelo Cancer Genome Atlas, um programa contínuo dos Institutos Nacionais de Saúde americana para coletar e catalogar os genomas de milhares de pacientes com câncer.
Ideker disse que a abordagem NBS tem utilidade clínica imediata. O sequenciamento do genoma de pacientes com câncer está rapidamente se tornando uma parte padrão do diagnóstico; portanto, de acordo com este cientista, os médicos podem usar o NBS para melhor adaptar um tratamento com o subtipo de câncer e, dependendo dos resultados do tratamento, Leve as descobertas de volta ao banco de dados para refinar e melhorar as terapias contra o câncer, para que sejam tão personalizadas quanto possível para os próprios indivíduos.
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Os tumores de câncer quase nunca compartilham as mesmas mutações genéticas exatas, fato que confundiu os esforços científicos para classificar melhor os tipos de câncer e desenvolver tratamentos mais específicos e eficazes.
"A subtipagem é o passo mais básico em direção à meta da medicina personalizada", disse o pesquisador principal Trey Ideker, chefe da divisão de Genética da Faculdade de Medicina da Universidade da Califórnia, em San Diego, e professor do Departamento de Medicina. Medicina e Bioengenharia do mesmo centro universitário.
"Com base nos dados do paciente, os pacientes são colocados em subtipos com tratamentos associados. Por exemplo, sabe-se que um subtipo de câncer responde bem ao medicamento A, mas não ao medicamento B. Sem subtipos, cada paciente tem o mesmo aspecto, por definição, e não sabemos como lidar de maneira diferente ", explicou.
Os recentes avanços no conhecimento e na tecnologia tornaram mais fácil (e mais barato) sequenciar genomas individuais, especialmente no tratamento de câncer, que é fundamentalmente uma doença dos genes.
Mas os genes são "tremendamente heterogêneos", disse Ideker. Os genes mutantes, influenciados por outros fatores, causam doenças como o câncer, uma patologia geneticamente única em cada paciente, fato que pode afetar a eficácia e os resultados do tratamento clínico.
"Quando analisamos os dados dos pacientes no nível dos genes, todos parecem diferentes", disse Ideker. "Mas se você olhar para as redes e os sistemas biológicos afetados, eles parecem ser aglomerados. Não há genes mutados no mesmo lugar, mas as mutações aparecem nos mesmos caminhos genéticos", disse esse especialista.
Especificamente, os cientistas observaram mutações somáticas, presentes em tumores, mas não em tecidos saudáveis, em dados de pacientes com câncer de pulmão, uterino e ovário compilados pelo Cancer Genome Atlas, um programa contínuo dos Institutos Nacionais de Saúde americana para coletar e catalogar os genomas de milhares de pacientes com câncer.
Ideker disse que a abordagem NBS tem utilidade clínica imediata. O sequenciamento do genoma de pacientes com câncer está rapidamente se tornando uma parte padrão do diagnóstico; portanto, de acordo com este cientista, os médicos podem usar o NBS para melhor adaptar um tratamento com o subtipo de câncer e, dependendo dos resultados do tratamento, Leve as descobertas de volta ao banco de dados para refinar e melhorar as terapias contra o câncer, para que sejam tão personalizadas quanto possível para os próprios indivíduos.
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